办理宠物托运证明有以下两个步骤：1、按照属地管理原则，到所在县区动物疫病预防控制中心、通过检验检测机构资质认定的实验室或通过兽医系统实验室考核的实验室进行检测，出具检测报告；2.携带合格检测报告、免疫证（打过疫苗的证明）、要办理检疫证明的宠物到所在县区动物卫生监督所办理检疫证明。